按照使用目的來看，集裝箱可分為普通集裝箱、冷凍集裝箱、開頂集裝箱、框架集裝箱、牲畜集裝箱等等。

普通集裝箱，也稱幹貨集裝箱，它以裝運件雜貨為主，通常用來裝運日用品、醫藥、工藝品、化工制品等。市面上這類集裝箱占集裝箱總數的70 %—80%。除了冷凍貨、活的動物、植物之外，大部分需要運輸的貨物都可以使用這類集裝箱。

冷凍集裝箱，分外置和內置式兩種。溫度可進行調整。內置式集裝箱在運輸過程中可隨意啟動冷凍機，讓集裝箱保持在指定溫度；而外置式則必須依靠集裝箱專用的冷凍機來制冷。

開頂集裝箱,又稱敞頂集裝箱、開頂櫃，正如它的名字一樣，這種集裝箱是沒有箱頂的，但有可折式頂梁支撐的頂篷，可用起重機從箱頂上面裝卸貨物，適合於裝載玻璃板、鋼制品、機械等重貨。——柳州住人集裝箱

框架集裝箱，這類集裝箱沒有箱頂和兩側，裝卸貨物時需要從側面裝卸。它主要運輸超重貨物及一些可以免除外包裝的裸裝貨。

牲畜集裝箱，側面采用金屬網，通風條件良好，且便於餵食，專為運輸牛、羊、馬等活動物。

罐式集裝箱，又稱液體集裝箱。這種集裝箱是在一個金屬框架裏固定一個液罐，是專為運輸食品、藥品、化工品等液體貨物的特殊集裝箱。

平臺集裝箱，具有高承載能力，沒有上部結構。適宜裝運超重超長貨物，且兩個平臺集裝箱可以聯結起來，很多汽車裝運都會選擇這種集裝箱。

通風集裝箱，這類集裝箱的箱壁設有4-6個通風孔，較為通風，內壁塗塑料層，適合裝新鮮蔬菜和水果等怕熱怕悶的貨物。

保溫集裝箱，箱內有隔熱層，箱頂有能調節角度的進出風口，可利用外界空氣和風向來調節箱內溫度，適合裝運對溫度濕度敏感的貨物。

散裝貨集裝箱，在頂部設有2~3個小艙口，以便裝貨。底部有升降架，可以升高成40°的傾斜角，以便卸貨。這種箱子適合裝運糧食、水泥等散貨。

散裝粉狀貨集裝箱，與散裝箱類似，但裝卸時使用噴管和吸管。

掛式集裝箱，箱裏的貨物可掛置，多用於運輸服裝類商品。